MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021872	AGG	2	6	25	30	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021872	ATT	2	6	33	38	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021872	TC	5	10	141	150	0 %	50 %	0 %	50 %	526230726
4	NC_021872	A	7	7	303	309	100 %	0 %	0 %	0 %	526230726
5	NC_021872	AGA	2	6	311	316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230726
6	NC_021872	CTT	2	6	328	333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230726
7	NC_021872	CTC	2	6	346	351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230726
8	NC_021872	GTT	2	6	381	386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230726
9	NC_021872	GCA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230726
10	NC_021872	TTGCCG	2	12	421	432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230726
11	NC_021872	TTTA	2	8	462	469	25 %	75 %	0 %	0 %	526230726
12	NC_021872	G	7	7	471	477	0 %	0 %	100 %	0 %	526230726
13	NC_021872	TAA	2	6	602	607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230726
14	NC_021872	AGA	2	6	626	631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230726
15	NC_021872	TGA	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230726
16	NC_021872	A	6	6	738	743	100 %	0 %	0 %	0 %	526230726
17	NC_021872	CTC	2	6	841	846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230726
18	NC_021872	ATATTG	2	12	898	909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	526230726
19	NC_021872	TATAA	2	10	1116	1125	60 %	40 %	0 %	0 %	526230726
20	NC_021872	CGG	2	6	1244	1249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230726
21	NC_021872	ACCAC	2	10	1255	1264	40 %	0 %	0 %	60 %	526230726
22	NC_021872	A	6	6	1301	1306	100 %	0 %	0 %	0 %	526230726
23	NC_021872	TAA	2	6	1376	1381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021872	CTA	3	9	1470	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021872	AT	3	6	1501	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021872	TA	3	6	1508	1513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021872	CATT	2	8	1562	1569	25 %	50 %	0 %	25 %	526230727
28	NC_021872	AAT	2	6	1579	1584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230727
29	NC_021872	CAATTC	2	12	1613	1624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230727
30	NC_021872	ACA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230727
31	NC_021872	TTA	2	6	1703	1708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230727
32	NC_021872	ATG	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230727
33	NC_021872	CTT	2	6	1773	1778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230727
34	NC_021872	A	6	6	1807	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	526230727
35	NC_021872	AAG	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230727
36	NC_021872	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230727
37	NC_021872	GAA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230727
38	NC_021872	CTG	2	6	2312	2317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230727
39	NC_021872	ATC	2	6	2352	2357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230727
40	NC_021872	GTTAA	2	10	2404	2413	40 %	40 %	20 %	0 %	526230727
41	NC_021872	GTG	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230727
42	NC_021872	GAA	2	6	2476	2481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230727
43	NC_021872	CGA	2	6	2573	2578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230727
44	NC_021872	AGA	2	6	2628	2633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230727
45	NC_021872	TA	3	6	2689	2694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021872	A	6	6	2703	2708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021872	GTTTT	2	10	2722	2731	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021872	TAA	2	6	2765	2770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021872	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021872	TAA	2	6	2866	2871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021872	AAT	2	6	2887	2892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021872	A	7	7	2922	2928	100 %	0 %	0 %	0 %	526230728
53	NC_021872	GAA	2	6	2931	2936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230728
54	NC_021872	TTGA	2	8	2946	2953	25 %	50 %	25 %	0 %	526230728
55	NC_021872	TTA	2	6	2962	2967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230728
56	NC_021872	AGA	2	6	2987	2992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230728
57	NC_021872	ATT	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230728
58	NC_021872	AGC	2	6	3014	3019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230728
59	NC_021872	ATG	2	6	3055	3060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230728
60	NC_021872	GAT	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230728
61	NC_021872	CGG	2	6	3072	3077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230728
62	NC_021872	AAGAT	2	10	3097	3106	60 %	20 %	20 %	0 %	526230728
63	NC_021872	ACC	2	6	3118	3123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230728
64	NC_021872	TTA	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230728
65	NC_021872	AGTA	2	8	3141	3148	50 %	25 %	25 %	0 %	526230728
66	NC_021872	TTA	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230729
67	NC_021872	TAA	2	6	3363	3368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230729
68	NC_021872	A	6	6	3430	3435	100 %	0 %	0 %	0 %	526230729
69	NC_021872	ATT	2	6	3499	3504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230729
70	NC_021872	GGA	2	6	3511	3516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230729
71	NC_021872	CGC	2	6	3548	3553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230729
72	NC_021872	A	7	7	3633	3639	100 %	0 %	0 %	0 %	526230729
73	NC_021872	CAA	2	6	3668	3673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230729
74	NC_021872	TGC	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230729
75	NC_021872	ATT	2	6	3734	3739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230729
76	NC_021872	T	6	6	3751	3756	0 %	100 %	0 %	0 %	526230729
77	NC_021872	TGA	2	6	3853	3858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230729
78	NC_021872	TAC	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230729
79	NC_021872	AAC	2	6	3934	3939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230729
80	NC_021872	GAT	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230729
81	NC_021872	ACA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230729
82	NC_021872	GATT	2	8	4054	4061	25 %	50 %	25 %	0 %	526230729
83	NC_021872	TGA	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230729
84	NC_021872	ATT	4	12	4090	4101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230729
85	NC_021872	AC	3	6	4139	4144	50 %	0 %	0 %	50 %	526230729
86	NC_021872	GAC	2	6	4183	4188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230729
87	NC_021872	TTAA	2	8	4217	4224	50 %	50 %	0 %	0 %	526230729
88	NC_021872	AGG	2	6	4266	4271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230729
89	NC_021872	AAC	2	6	4289	4294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230730
90	NC_021872	ATG	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230730
91	NC_021872	TCA	2	6	4419	4424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230730
92	NC_021872	TGA	2	6	4479	4484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230730
93	NC_021872	TGT	2	6	4491	4496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230730
94	NC_021872	GGA	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230730
95	NC_021872	TGGCGG	2	12	4623	4634	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	526230730
96	NC_021872	TGT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230730
97	NC_021872	TAC	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230730
98	NC_021872	AAC	2	6	4854	4859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230730
99	NC_021872	AG	3	6	4894	4899	50 %	0 %	50 %	0 %	526230730
100	NC_021872	GGT	2	6	4984	4989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230730
101	NC_021872	CCA	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230730
102	NC_021872	GCA	2	6	5114	5119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230730
103	NC_021872	TCA	2	6	5201	5206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230730
104	NC_021872	AGACTA	2	12	5327	5338	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	526230730
105	NC_021872	TTA	2	6	5404	5409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230730
106	NC_021872	ATT	2	6	5434	5439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230730
107	NC_021872	GCT	2	6	5473	5478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230730
108	NC_021872	ATT	2	6	5580	5585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230730
109	NC_021872	CCG	2	6	5914	5919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230730
110	NC_021872	TGA	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230730
111	NC_021872	ACA	2	6	6070	6075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230730
112	NC_021872	GAC	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230730
113	NC_021872	TGT	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021872	A	6	6	6253	6258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021872	GGA	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021872	GAAT	3	12	6428	6439	50 %	25 %	25 %	0 %	526230731
117	NC_021872	AAG	2	6	6466	6471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230731
118	NC_021872	TTG	2	6	6581	6586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230731
119	NC_021872	TGATGG	2	12	6612	6623	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	526230731
120	NC_021872	GCC	2	6	6628	6633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230731
121	NC_021872	ATG	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230731
122	NC_021872	TTA	2	6	6772	6777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230731
123	NC_021872	CTA	2	6	6812	6817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230731
124	NC_021872	TTA	2	6	6845	6850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230731
125	NC_021872	TGG	2	6	6933	6938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230731
126	NC_021872	AGT	2	6	6939	6944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230731
127	NC_021872	TAT	2	6	6993	6998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230731
128	NC_021872	GAA	2	6	7021	7026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230731
129	NC_021872	AGA	2	6	7028	7033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230731
130	NC_021872	TAA	2	6	7077	7082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230731
131	NC_021872	TCG	2	6	7194	7199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230731
132	NC_021872	AAT	2	6	7225	7230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230731
133	NC_021872	AAC	2	6	7254	7259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230731
134	NC_021872	ACG	3	9	7359	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230731
135	NC_021872	AAAG	2	8	7383	7390	75 %	0 %	25 %	0 %	526230731
136	NC_021872	TTG	2	6	7409	7414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230731
137	NC_021872	TGA	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230731
138	NC_021872	TAAT	2	8	7451	7458	50 %	50 %	0 %	0 %	526230731
139	NC_021872	ATT	2	6	7459	7464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230731
140	NC_021872	TGA	2	6	7502	7507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230731
141	NC_021872	AATCA	2	10	7666	7675	60 %	20 %	0 %	20 %	526230731
142	NC_021872	ATG	2	6	7679	7684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230731
143	NC_021872	CGG	2	6	7720	7725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230731
144	NC_021872	GAA	3	9	7777	7785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230731
145	NC_021872	TGA	2	6	7836	7841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230731
146	NC_021872	GAT	2	6	7897	7902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230731
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148	NC_021872	CTT	2	6	7947	7952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230731
149	NC_021872	GCT	2	6	8011	8016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230731
150	NC_021872	ATT	2	6	8029	8034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230731
151	NC_021872	CTT	2	6	8038	8043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230731
152	NC_021872	TAA	3	9	8049	8057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230731
153	NC_021872	AGA	2	6	8060	8065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230731
154	NC_021872	GAT	3	9	8101	8109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230731
155	NC_021872	TCT	2	6	8117	8122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230731
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158	NC_021872	ATTG	2	8	8223	8230	25 %	50 %	25 %	0 %	526230731
159	NC_021872	TTA	2	6	8240	8245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230731
160	NC_021872	ATC	2	6	8301	8306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230731
161	NC_021872	GTT	2	6	8308	8313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230731
162	NC_021872	TTGG	2	8	8527	8534	0 %	50 %	50 %	0 %	526230731
163	NC_021872	TGA	2	6	8553	8558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230731
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165	NC_021872	TTAA	2	8	8650	8657	50 %	50 %	0 %	0 %	526230731
166	NC_021872	TGA	2	6	8709	8714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230731
167	NC_021872	GAA	2	6	8722	8727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230731
168	NC_021872	TAA	2	6	8733	8738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230731
169	NC_021872	AAG	2	6	8747	8752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230731
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171	NC_021872	A	7	7	8774	8780	100 %	0 %	0 %	0 %	526230731
172	NC_021872	TA	4	8	8807	8814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021872	TTC	2	6	8927	8932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_021872	AGG	2	6	8962	8967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_021872	TAAAG	2	10	9287	9296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021872	AG	3	6	9295	9300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021872	CAG	2	6	9382	9387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230733
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200	NC_021872	TAA	2	6	10165	10170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_021872	TAT	2	6	10197	10202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_021872	ACCAA	2	10	10387	10396	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
203	NC_021872	A	6	6	10457	10462	100 %	0 %	0 %	0 %	526232157
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232	NC_021872	TTAC	2	8	11713	11720	25 %	50 %	0 %	25 %	526232157
233	NC_021872	TGATA	2	10	11857	11866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
234	NC_021872	TAA	2	6	11879	11884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_021872	AGG	2	6	11900	11905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
236	NC_021872	TA	3	6	11984	11989	50 %	50 %	0 %	0 %	526230735
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249	NC_021872	TGA	2	6	12600	12605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230735
250	NC_021872	TGA	3	9	12613	12621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230735
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253	NC_021872	GTT	3	9	12833	12841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230735
254	NC_021872	TGG	2	6	12871	12876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230735
255	NC_021872	GAT	2	6	12919	12924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230735
256	NC_021872	ATT	2	6	12964	12969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230735
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258	NC_021872	ATT	2	6	13145	13150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230735
259	NC_021872	CAA	2	6	13176	13181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230735
260	NC_021872	TTA	2	6	13190	13195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230735
261	NC_021872	ACC	2	6	13278	13283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230735
262	NC_021872	TCG	2	6	13285	13290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230735
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266	NC_021872	ATG	2	6	13571	13576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230735
267	NC_021872	AAAT	2	8	13602	13609	75 %	25 %	0 %	0 %	526230735
268	NC_021872	GCT	2	6	13673	13678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230735
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273	NC_021872	AGTT	2	8	13875	13882	25 %	50 %	25 %	0 %	526230735
274	NC_021872	CTAA	2	8	13889	13896	50 %	25 %	0 %	25 %	526230735
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280	NC_021872	TGC	2	6	14106	14111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230736
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377	NC_021872	A	6	6	18461	18466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_021872	A	6	6	18670	18675	100 %	0 %	0 %	0 %	526232158
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386	NC_021872	AAAAT	2	10	18759	18768	80 %	20 %	0 %	0 %	526232158
387	NC_021872	TC	3	6	18854	18859	0 %	50 %	0 %	50 %	526232158
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389	NC_021872	AT	3	6	18885	18890	50 %	50 %	0 %	0 %	526232158
390	NC_021872	AAG	2	6	18903	18908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232158
391	NC_021872	TGT	2	6	18932	18937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232158
392	NC_021872	TTG	2	6	18990	18995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232158
393	NC_021872	CTC	2	6	19056	19061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
394	NC_021872	TAG	2	6	19087	19092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
395	NC_021872	TA	3	6	19125	19130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_021872	A	6	6	19154	19159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_021872	ATT	2	6	19163	19168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_021872	ATTC	2	8	19178	19185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
399	NC_021872	A	6	6	19186	19191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_021872	TA	3	6	19207	19212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_021872	GCA	2	6	19243	19248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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